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La prise du Black Pearl se fait suite à la recherche d'eau et de vivres sur une île, elle se fait avec l'arrivé de L'Impératrice qui arraisonne le Pearl puis du HMS Endeavour.
Sur l'île se sont donc les hommes du Hai Pheng qui la commence. Ils forcent ceux du Pearl dont Jack Sparrow et Barbossa à remonter sur leurs chaloupes et à regagner le Pearl.
Sur le Black Pearl,c'est William Turner qui provoque la mutinerie du Pearl au coté des quelques hommes du Hai Pheng qui y sont restés et qui ont combattus Gibbs, Elizabeth Swan et leurs amis.
Une fois Barbossa et Sparrow revenu sur le Pearl avec les leurs, ils ont la surprise de voire Sao Feng et ses hommes occupé le Pearl, puis ils voient l'Endeavour approcher, ce qui marque le déclin de la puissance du Pearl mais les négociations battent à leurs pleins d'abord Cutler Beckett propose à Jack Sparrow de lui fournir des information sur l'identité des seigneurs des pirates, le lieu de rassemblement de la confrérie et l'utilisation des 9 pièces des 8, entretemps Sao Feng propose à Hector Barbossa de lui donner celle qu'il pense être Calypso ( dans le film, il dit "La fille" ) Elizabeth Swann finit par accepter la proposition en raison de la mutinerie sur le Pearl orchestrée par William Turner et qui en résultent par la libération du Pearl et de son équipage et de la livraison de l'ensemble de la confrérie lors de l'ultime affrontement.
Suite à la libération du Pearl et de son équipage, les pirates de Black Pearl commencent le combat contre l'agent Ian Mercer et ses hommes en raison de leur différences de status, les pirates prennent l'avantage total sur les anglais en leur infligeant une défaite militaire et matériel en raison de la perte des hommes de Ian Mercer et du grand mat brisé en deux du HMS Endeavour qui finit par tomber sur son propre pont principal, ce qui retarde les plans de Cutler Beckett qui perd du temps pour sa traque et l'extermination en intégralité des pirates du monde entier.